Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
P3H3Q8IVL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
P3H3Q8IVL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
P3H3Q8IVL6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
P3H3Q8IVL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
P3H3Q8IVL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms