Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBBP6Q7Z6E9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBBP6Q7Z6E9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBBP6Q7Z6E9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP6Q7Z6E9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms