Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMIGD1Q6UXZ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMIGD1Q6UXZ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms