Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRIP3Q6Q6R5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRIP3Q6Q6R5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRIP3Q6Q6R5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms