Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFCAB12Q6NXP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms