Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRNIPQ6NTE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRNIPQ6NTE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRNIPQ6NTE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRNIPQ6NTE8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms