Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPTY2D1Q68D10 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPTY2D1Q68D10 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SPTY2D1Q68D10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPTY2D1Q68D10 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms