Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E4F1Q66K89 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E4F1Q66K89 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E4F1Q66K89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms