Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRAGBQ5VZM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRAGBQ5VZM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRAGBQ5VZM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms