Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDHAF4Q5VUM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHAF4Q5VUM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDHAF4Q5VUM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms