Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF20Q5VTR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF20Q5VTR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF20Q5VTR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms