Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP47Q5SQN1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP47Q5SQN1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms