Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZC3H12AQ5D1E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZC3H12AQ5D1E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZC3H12AQ5D1E8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZC3H12AQ5D1E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms