Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC93Q567U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC93Q567U6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC93Q567U6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms