Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP5B1Q2VPB7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP5B1Q2VPB7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP5B1Q2VPB7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms