Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC96Q2M329 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC96Q2M329 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC96Q2M329 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1148.5 ms