Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ISXQ2M1V0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ISXQ2M1V0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms