Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FXNQ16595 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FXNQ16595 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FXNQ16595 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FXNQ16595 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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FXNQ16595 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FXNQ16595 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FXNQ16595 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FXNQ16595 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FXNQ16595 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FXNQ16595 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FXNQ16595 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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