Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1EQ15878 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1EQ15878 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1EQ15878 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms