Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
R3HDM1Q15032 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
R3HDM1Q15032 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
R3HDM1Q15032 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
R3HDM1Q15032 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
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