Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP1BQ14684 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRP1BQ14684 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP1BQ14684 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms