Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SCN5AQ14524 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN5AQ14524 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN5AQ14524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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