Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD9Q14511 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD9Q14511 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD9Q14511 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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