Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTCH1Q13635 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PTCH1Q13635 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTCH1Q13635 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTCH1Q13635 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTCH1Q13635 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PTCH1Q13635 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PTCH1Q13635 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PTCH1Q13635 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTCH1Q13635 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTCH1Q13635 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTCH1Q13635 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTCH1Q13635 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
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