Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIGQ13278 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIGQ13278 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIGQ13278 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RIGQ13278 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RIGQ13278 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RIGQ13278 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RIGQ13278 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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