Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRJQ12913 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRJQ12913 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRJQ12913 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms