Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP4Q09028 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBBP4Q09028 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms