Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX4Q06945 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX4Q06945 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX4Q06945 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX4Q06945 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms