Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms