Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS35P82673 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS35P82673 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS35P82673 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms