Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PIP4K2BP78356 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIP4K2BP78356 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PIP4K2BP78356 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIP4K2BP78356 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIP4K2BP78356 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms