Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTC1P68032 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTC1P68032 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTC1P68032 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms