Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK11-1P61568 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK11-1P61568 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK11-1P61568 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms