Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BPIFB4P59827 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFB4P59827 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFB4P59827 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms