Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP107P57740 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP107P57740 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP107P57740 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP107P57740 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP107P57740 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP107P57740 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP107P57740 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP107P57740 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP107P57740 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP107P57740 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP107P57740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP107P57740 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP107P57740 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP107P57740 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP107P57740 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP107P57740 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP107P57740 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP107P57740 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP107P57740 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP107P57740 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP107P57740 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP107P57740 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP107P57740 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP107P57740 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms