Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN18P56856 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN18P56856 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN18P56856 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms