Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRPF1P55201 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRPF1P55201 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BRPF1P55201 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
BRPF1P55201 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms