Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GYS2P54840 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GYS2P54840 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GYS2P54840 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GYS2P54840 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GYS2P54840 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYS2P54840 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYS2P54840 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GYS2P54840 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYS2P54840 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYS2P54840 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYS2P54840 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYS2P54840 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GYS2P54840 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GYS2P54840 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYS2P54840 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GYS2P54840 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYS2P54840 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYS2P54840 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GYS2P54840 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GYS2P54840 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GYS2P54840 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GYS2P54840 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GYS2P54840 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GYS2P54840 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GYS2P54840 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GYS2P54840 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GYS2P54840 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GYS2P54840 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GYS2P54840 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYS2P54840 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYS2P54840 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYS2P54840 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GYS2P54840 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GYS2P54840 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GYS2P54840 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GYS2P54840 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GYS2P54840 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GYS2P54840 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GYS2P54840 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GYS2P54840 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GYS2P54840 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GYS2P54840 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GYS2P54840 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GYS2P54840 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GYS2P54840 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYS2P54840 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYS2P54840 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYS2P54840 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYS2P54840 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms