Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24CP53992 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24CP53992 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms