Protein–RNA interactions for Protein: P51452

DUSP3, Dual specificity protein phosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP3P51452 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP3P51452 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP3P51452 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP3P51452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms