Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA1P49639 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA1P49639 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HOXA1P49639 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms