Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPAP49450 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPAP49450 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPAP49450 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPAP49450 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPAP49450 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPAP49450 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPAP49450 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPAP49450 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPAP49450 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPAP49450 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPAP49450 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPAP49450 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPAP49450 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPAP49450 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPAP49450 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPAP49450 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPAP49450 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms