Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCKSL1P49006 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSL1P49006 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSL1P49006 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms