Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
NESP48681 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NESP48681 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
NESP48681 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
NESP48681 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
NESP48681 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
NESP48681 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NESP48681 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NESP48681 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NESP48681 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NESP48681 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NESP48681 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NESP48681 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NESP48681 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
NESP48681 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NESP48681 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
NESP48681 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NESP48681 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NESP48681 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NESP48681 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NESP48681 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NESP48681 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NESP48681 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NESP48681 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NESP48681 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NESP48681 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
NESP48681 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NESP48681 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NESP48681 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NESP48681 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NESP48681 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NESP48681 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
NESP48681 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
NESP48681 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
NESP48681 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NESP48681 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NESP48681 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NESP48681 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NESP48681 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
NESP48681 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NESP48681 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
NESP48681 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NESP48681 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NESP48681 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NESP48681 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
NESP48681 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NESP48681 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
NESP48681 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
NESP48681 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NESP48681 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
NESP48681 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NESP48681 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NESP48681 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NESP48681 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NESP48681 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NESP48681 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NESP48681 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NESP48681 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
NESP48681 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
NESP48681 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NESP48681 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NESP48681 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
NESP48681 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NESP48681 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NESP48681 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NESP48681 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NESP48681 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NESP48681 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NESP48681 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NESP48681 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms