Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IQGAP1P46940 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IQGAP1P46940 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IQGAP1P46940 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IQGAP1P46940 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms