Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTR1BP42025 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR1BP42025 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR1BP42025 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms