Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOLR3P41439 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR3P41439 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOLR3P41439 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms