Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3P39023 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3P39023 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3P39023 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3P39023 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3P39023 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3P39023 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3P39023 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3P39023 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3P39023 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3P39023 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3P39023 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL3P39023 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3P39023 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3P39023 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3P39023 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3P39023 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3P39023 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3P39023 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3P39023 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3P39023 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3P39023 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3P39023 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL3P39023 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3P39023 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3P39023 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms