Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IGHMBP2P38935 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGHMBP2P38935 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGHMBP2P38935 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms