Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SSFA2P28290 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SSFA2P28290 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SSFA2P28290 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SSFA2P28290 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms